保税区依照自由贸易区模式，采取某些自由港政策，按国际惯例运作。在保税区内使用的进口生产设备、物资、办公用品以及加工出口所需料件包装物料等免征进口关税、增值税、消费税；货物从境外运入保税区或从保税区运出境外，免关税、免许可证。

沙头角保税区：现规划区内用地30万平方米，以发展先进的外向型工业为主，幷适当发展进出口贸易、转口贸易、仓储、运输、房地产及其它第三产业。

福田保税区：现有开发面积为1.35平方公里，配套生活区面积0.63平方公里。主要发展国际贸易、仓储、先进工业及高新技术产业，相应发展金融、信息、商品展示、商贸服务行业。

盐田港保税区：首期开发0.85平方公里，以发展转口贸易和仓储功能为主，适当发展保税区生产资料市场、商品展销、分类、改装、混合、加工及金融、保险、信息、运输等业务。

高新技术产业园区

深圳市高新技术产业园区属中国国家级高新技术产业园区，占地面积11.5平方公里。主要发展电子信息、生物工程、新材料、光机电一体化等四大产业，其中电子信息产业是高新区的重点支柱产业。

龙岗大工业区

龙岗大工业区面积174.4平方公里，可建设用地109平方公里，规划面积80.9平方公里。大工业区作为大型工业基地，以制造业为主体，以先进技术工业项目为核心，配套兴办金融、房地产、贸易、服务业等第三产业，大力发展计算器及其软件、微电子及元器件、通讯产业、视听产业、机电一体化、仪器仪表、精细化工、医药及生物工程工业、金属材料工业、轻纺工业、机械加工和汽车工业等先进技术产业和基础产业。